• Ταξινομική, Φυλογενετική και Λειτουργική Ποικιλότητα
  • Φυλογένεση γενών της Ελληνικής χλωρίδας
  • Βιοποικιλότητα και κλιματική αλλαγή
  • Χλωρίδα και Φυτογεωγραφία
  • Παρακολούθηση, Αξιολόγηση και Διαχείριση βιοποικιλότητας
  • Βιολογία Διατήρησης, Χαρτογράφηση βλάστησης, οικοτόπων και οικοσυστημάτων
  • Διαχείριση οικοσυστημάτων, οικοτόπων και ειδών
  • Χαρτογράφηση και Αξιολόγηση Οικοσυστημάτων και Οικοσυστημικών Υπηρεσιών
  • Φυτοκοινωνιολογικές έρευνες βλάστησης και Οικολογίας Βλάστησης
  • Μηχανισμοί της φωτοσύνθεσης σε αυτοφυή και καλλιεργούμενα φυτά (εποχιακές και αναπτυξιακές μεταβολές, φωτοπροστασία, φωτοσύνθεση βλαστών και καρπών, φωτοσύνθεση σε ιστούς με υψηλή περιεκτικότητα ανθοκυανινών)
  • Επιπτώσεις περιβαλλοντικών καταπονήσεων στη φυσιολογική λειτουργία των φυτών (ξηρασία, υψηλές/χαμηλές θερμοκρασίες, UV-ακτινοβολία, κλπ)
  • Εφαρμογές των τεχνικών φθορισμού της χλωροφύλλης (stress, συμβιώσεις, αποκρίσεις σε παθογόνα, τοξικότητα)
  • Αποκρίσεις της φωτοσυνθετικής συσκευής φυκών σε εφαρμογές απορρύπανσης
  • Ανάλυση ουσιών με αντιοξειδωτική δράση
  • Οικολογία & Διαχείριση των εσωτερικών υδάτων
  • Αξιολόγηση της Οικολογικής Ποιότητας του Νερού, Βιολογική παρακολούθηση (monitoring), Είδη βιο-δείκτες (WFD 2000/60/ΕΕ quality element; macrophytes)
  • Επιδράσεις κλιματικών αλλαγών στα υδάτινα οικοσυστήματα. Ανάλυση τοπίου, καλύψεων /χρήσεων γης με τεχνικές τηλεπισκόπησης & GIS.
  • Παρακολούθηση της Βιοποικιλότητας, Αξιολόγηση κατάστασης διατήρησης τύπων οικοτόπων και ειδών, Φορείς Διαχείρισης των περιοχών NATURA 2000 (άρθρο 17 Dir. 92/43, Σχέδια Διαχείρισης).
  • Χωρικά & Χρονικά Πρότυπα και διεργασίες βιοποικιλότητας ζωικών κοινοτήτων
  • Eξελικτική οικολογία χερσόβιων ζώων (Διεργασίες ενδογένεσης, φυλογεωγραφία, συμπεριφορικές, μορφολογικές, οικολογικές & πληθυσμιακές προσαρμογές)
  • Φυλογενετικές σχέσεις (Γενετικές, μοριακές & κυτταρολογικές μέθοδοι)
  • Βιολογική ωκεανογραφία & αλιευτική διαχείριση
  • Αφθονία, κατανομή & συμπεριφορά των θαλασσίων οργανισμών
  • Συνέπειες του περιβάλλοντος & των κλιματικών αλλαγών στα θαλάσσια οικοσυστήματα και στους εκμεταλλευόμενους πληθυσμούς
  • Υδατοκαλλιέργειες (Ιχθυονύμφες, ζωοπλαγκτόν, χρήση προβιοτικών)
  • Καλλιέργεια φυτοπλαγκτόν (μείωση εκλύσεων CO2, παραγωγή βιοντίζελ & βιοτεχνολογικών προϊόντων)
  • Επαγωγή οξειδωτικών & γενοτοξικών επιπτώσεων σε υδρόβιους οργανισμούς, μετά από έκθεση σε ρυπογόνους παράγοντες
  • Βιομαρτύρες σε ιστούς Βιοενδείκτες οργανισμούς (Εκτίμηση των επιπτώσεων ρυπογόνων ουσιών – ανόργανων & οργανικών)
  • Παρακολούθηση της ποιότητας/κατάστασης του θαλάσσιου περιβάλλοντος με χρήση οργανισμών Βιοενδεικτών
  • Υδατική Τοξικολογία (Δοκιμές τοξικότητας σε υδρόβιους οργανισμούς των γλυκών και αλμυρών υδάτων)
  • Εμβρυική ανάπτυξη εγκεφάλου
  • Νευροβιολογική βάση της συμπεριφοράς και του στρες
  • Παθοφυσιολογία του κεντρικού νευρικού συστήματος
  • Μηχανισμοί νευροπροστασίας & νευροεκφύλισης
  • Επίδραση φυτικών εκχυλισμάτων στο κεντρικό νευρικό σύστημα
  • Αναπτυξιακή νευροβιολογία (πολλαπλασιασμός μετανάστευση νευρικών κυττάρων & ρόλος νευροδιαβιβαστικών συστημάτων)
  • Μηχανισμοί πλαστικότητας στον ώριμο εγκέφαλο (επίδραση επί-γενετικών παραγόντων στην εγκεφαλική λειτουργία – φυλετικές ορμόνες, τραύμα, υπέρταση, μοντέλα μάθησης)
  • Πρωτεϊνικός πολυμορφισμός και αλληλεπιδράσεις μεταξύ βιολογικών μακρομορίων.
  • Έκφραση, απομόνωση και κρυστάλλωση πρωτεϊνών/ πεπτιδίων.
  • Μελέτη πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος και βιολογικών μακρομορίων προερχόμενων από ιούς με στόχο την δημιουργία φαρμάκων και εμβολίων.
  • Κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ – Δομική ανάλυση υλικών συμπεριλαμβανομένων  των βιολογικών μακρομορίων.
  • Ανάπτυξη νέων πειραματικών μεθόδων για την δομική βιολογία.
  • Χρήση ακτινοβολίας σύγχροτρον για δομική ανάλυση υλικών. Χρήση περίθλασης ακτίνων Χ απο μονοκρυστάλλους και πολυκρυσταλλικά υλικά (single crystal/ powder diffraction), συλλογή δεδομένων και ανάλυση δεδομένων για επίλυση πρωτεϊνικών δομών.
  • Διαφοροποίηση και λειτουργία των ΝΚ [Natural Killer] κυττάρων.
  • Μελέτη του φαινομένου της ανοχής των ΝΚ κυττάρων σε μοριακό και κυτταρικό επίπεδο.
  • Μελέτη του ρόλου των ΝΚ, Τ και ΝΚ-Τ κυττάρων σε νόσους του ανοσοποιητικού συστήματος.
  • Μελέτη της δράσης αυξητικών παραγόντων.
  • Μελέτη της αντικαρκινικής ή/και  αντιαγγειογενετικής δράσης πεπτιδίων.
  • Πληθυσμιακή και Εξελικτική Γενετική
  • Μελέτη αναπαραγωγικών απομονωτικών μηχανισμών
  • Μελέτη της γενετικής δομής πληθυσμών με χρήση μοριακών δεικτών
  • Γενετική ταυτοποίηση και ταξινόμηση ζωικών πληθυσμών
  • Μελέτη των Φυλογενετικών σχέσεων πληθυσμών
  • Γενετική βάση πολυπαραγοντικών ασθενειών
  • Αλληλεπίδραση γονιδίων και περιβάλλοντος (μικροβίωμα) – επιγονιδιωματική
  • Φαρμακογενετική/Φαρμακογονιδιωματική
  • Λειτουργική ανάλυση γονιδίων σε in vitro συστήματα και διαγονιδιακά μοντέλα ασθενειών του ανθρώπου

Μικροβιακή Βιοχημεία:

  • Μελέτη αποθεματικών και πολικών λιπιδίων μικροοργανισμών.

Μικροβιακή Βιοτεχνολογία

  • Ελαιογόνοι μικροοργανισμοί.
  • Παραγωγή λιπιδίων φαρμακευτικού ενδιαφέροντος.
  • Πολυακόρεστα λιπαρά οξέα.
  • Αλκοολική ζύμωση.
  • Απόκριση στη στεροειδή ορμόνη, εκδυσόνη, στη Μεσογειακή μύγα, Ceratitis capitata
  • Ρύθμιση και λειτουργία των θερμοεπαγόμενων γονιδίων της Μεσογειακής μύγας
  • Ανάπτυξη μοριακών-γενετικών εργαλείων και μεθόδων για το βιολογικό έλεγχο της Μεσογειακής μύγας

Δημοσιεύσεις μελών Τμήματος Βιολογίας